La institución Ferial de Badajoz es gobernada por una Junta Directiva y gestionada por el Vicepresidente de la misma junto con el equipo asesor. La Junta Directiva de la Institución está compuesta por 13 miembros de la siguiente forma:

• Presidente: Don Francisco Javier Fragoso (Alcalde del Ayuntamiento de Badajoz)
• Vicepresidente: Doña Blanca Subirán Pacheco (Concejala Delegada IFEBA)

• 7 Vocales miembros de la Corporación Municipal, nombrados por el Ayuntamiento en Pleno a propuesta de los portavoces de los Grupos Políticos con representación corporativa, cuyo número será proporcional a la representación obtenida por cada uno de estos Grupos en las correspondientes elecciones municipales. Los portavoces podrán designar también suplentes de sus vocales titulares, con carácter permanente o para una sesión concreta, mediante escrito dirigido al Presidente de la Junta Directiva. En el caso de que el Presidente delegue su cargo por tiempo indefinido en el Vicepresidente, se incorporará como vocal un miembro del mismo Grupo Municipal de aquel.
•  Un representante de la Consejería competente en materia de comercio de la Junta de Extremadura, que asistirá a las reuniones de la Junta Directiva con voz pero sin voto.

• Secretario: D. Mario Hermida Ferrer (Secretario General del Ayuntamiento).
• Dª. Raquel Rodríguez Román ( Interventora Municipal).
• Dª. Cristina Narro Prieto (Tesorera Municipal).