Se trata de la capilla, recientemente restaurada para acoger el Sagrario de la Catedral, del viejo convento de observantes de San Francisco, luego ocupado también por los jesuitas durante cierto tiempo. Su fábrica fue levantada en los inicios del siglo XVIII, siendo costeada por el monarca Juan V de Portugal. La iglesia presenta una enorme espacialidad, coronándose mediante una espectacular cúpula de media naranja dispuesta sobre el crucero.